医院目前有5个国家临床重点专科：针灸科、肝病科、心脑血管科、眼科、护理学；11个国家中医药管理局重点专科：肝病科、眼科、心血管科、儿科、骨伤科、妇产科、外科、耳鼻喉科、风湿病科、重症医学科、护理学；7个国家中医药管理局重点学科：中医眼科学、中医肝胆病学、中医妇科学、针灸科、中医儿科学、中医男科学、中医耳鼻喉科学。
1个国家卫生部中西医结合妇科腔镜培训基地；1个国家教育部省部共建重点实验室：中医内科学实验室；2个国家中医药管理局三级中医药科研实验室：中药药理(心血管)实验室、肝病病理实验室；2个国家中医药管理局重点研究室:经穴-脏腑相关重点研究室、超微中药临床应用重点研究室；2个湖南省中西医结合医疗中心：心脏病诊疗中心和微创外科中心；2个省重点学科：中医内科学、中医五官科学；7个省级重点中医专科：前列腺病与男性不育科、妇产科、瘫痪病症专科、脑病康复科、肺病科、中医耳鼻咽喉专科、急诊科。
